Populaarse otome-mängu põhjal jälgib Hakuouki Chizurut ja Shinsengumit alternatiivses reaalsuses. Chizuru sõidab kadunud isa otsima Kyotosse, kuid pärast juhtumisse sattumist sattus ta lõpuks Shinsengumi juurde, kus ta kohtus liikmetega, sealhulgas kuulsate Hijikata Toshizo ja Okita Soshiga. Chizuru isa viis Shinsengumi tugevdamiseks läbi valitsuse uuringuid ja arendas ochimizut. Ochimizu on valem, mis annab deemonile sarnase jõu ja taastumisefekti, kuid kui see on võetud, kogeb kasutaja äärmist valu ja muutub lõpuks verenäljaks koletiseks.
Püüdes Chizurut kaitsta, võtab Hijikata ochimizu ja ehkki olukord päästeti, mõjutab see haigus teda nüüd. Ka Okita on sunnitud valemi võtma, kui tema tuberkuloos takistab tal Chizurut ja ennast kaitsta. Tundes end oma tegude eest vastutavana, peab Chizuru võitlema oma abituse tundega ja leidma julguse Shinsengumit toetada.
