Surnute gümnaasium asub tänapäeva Jaapanis, alustades sellest, et planeeti tabab surmaga lõppev pandeemia, mis muudab inimesed zombideks, mida eufemistlikult tähistatakse esmastest tegelastest kui neid (?? Yatsura?).
Lugu järgib paljusid gümnaasiumiõpilasi (ja ka kolledžiõde), kui nad saavad hakkama kogu maailmas toimuva katastroofilise sündmuse, mille nimi on “puhang”. Samuti peavad nad silmitsi seisma sotsiaalse languse täiendavate riskidega, nagu ohtlikud ellujääjad, ja nende konkreetsete moraalikoodeksite võimaliku lagunemisega, kui valatud katsed zombie-apokalüpsis üle elada. Alates õppekavast põgenevad õpilased linna, kus nad peavad toime tulema tema õpilaste ja rikutud õpetajaga. Nad saavad nii koera kui ka väikese tüdruku ja hindavad nende majades ellujäänuid. Pärast jõuavad nad lõpuks algkooli, mis on väidetavalt turvaline tsoon, läbivad politseijaoskonna ja kestavad viimati kaubanduskeskuses.
